Hierarchical Order Parameters for Macromolecular Assembly Simulations. 1. Construction and Dynamical Properties of Order Parameters

نویسندگان
چکیده

برای دانلود رایگان متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Variational Properties of Unbounded Order Parameters

Order parameters in physical and biological systems can sometimes become unbounded as the size of an underlying system increases. It is proposed that such a quantity be modeled as a minimizer of the energy functional Iε(u) = − ∫ [ ε2 2 |∇u| − 1 2 log(1 + |u|) ] dx, where u is constrained by a side condition, and ε > 0 is a parameter that is inversely proportional to the linear size of the syste...

متن کامل

technical and legal parameters for determination of river boundary,( case study haraz river)

چکیده با توسعه شهر نشینی و دخل و تصرف غیر مجاز در حریم رودخانه ها خسارات زیادی به رودخانه و محیط زیست اطراف آن وارده می شود. در حال حاضر بر اساس آئین نامه اصلاح شده بستر و حریم رودخانه ها، حریم کمی رودخانه که بلافاصله پس از بستر قرار می گیرد از 1 تا20 متر از منتهی الیه طرفین بستر رودخانه تعیین، که مقدار دقیق آن در هر بازه از رودخانه مشخص نیست. در کشورهای دیگر روشهای متفاوتی من جمله: درصد ریسک...

15 صفحه اول

Identification of slow molecular order parameters for Markov model construction.

A goal in the kinetic characterization of a macromolecular system is the description of its slow relaxation processes via (i) identification of the structural changes involved in these processes and (ii) estimation of the rates or timescales at which these slow processes occur. Most of the approaches to this task, including Markov models, master-equation models, and kinetic network models, star...

متن کامل

Universal construction of order parameters for translation-invariant quantum lattice systems with symmetry-breaking order.

For any translation-invariant quantum lattice system with a symmetry group G, we propose a practical and universal construction of order parameters which identify quantum phase transitions with symmetry-breaking order. They are defined in terms of the fidelity between a ground state and its symmetry-transformed counterpart, and are computed through tensor network representations of the ground-s...

متن کامل

Confinement -deconfinement Order Parameters

We study numerically the monopole creation operator proposed recently by Fröhlich and Marchetti. The operator is defined with the help of a three dimensional model which generates random Mandelstam strings. These strings imitate the Coulombic magnetic field around the monopole. We show that if the Mandelstam strings are condensed the creation operator discriminates between the phases with conde...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Journal of Chemical Theory and Computation

سال: 2012

ISSN: 1549-9618,1549-9626

DOI: 10.1021/ct200574x